巴基斯坦国防体制，根据规定，总统为全国武装力量最高统帅。最高军事决策机关为内阁防务委员会，其成员包括国防部长、外交部长、财政部长、内政部长等，主席由总统兼任。参谋长联席会议主席、三军参谋长、国防部秘书长等一般也出席防务委员会会议。国防部是政府中的一个部，是最高军事行政机关，主要贯彻执行内阁防务委员会的决议、负责三军的财务管理、武器装备的生产与採购。国防部下设防务局、生产局和国防情报局，首脑虽为部长，但主持日常工作的是国防部秘书长。参谋长联席会议行政上受国防部领导，军事上受总统领导，主要负责拟定三军联合战略计画、研究武装力量的兵力与编成、向内阁防务委员会提供国防谘询，其成员由三军参谋长和国防部秘书长组成，主席由三军参谋长轮流担任，任期3年。其武装力量由正规军、準军事部队和预备役部队组成，其中正规军分陆、海、空三军，準军事部队包括国民警卫队、边防部队、内务部所属的别动队等。总统通过国防部长和参谋长联席会议对全军实施领导和指挥。