一个男子在从未见过的房间醒来，惊恐发现对自我的陌生与不安。隔壁女子悽怨沉痛的叫喊，向他诉说两人的关係，诡异而惨绝的讯息更令他恐惧。一位名叫若林镜太郎的人出现，自称代替已故的正木教授来完成以男子为实验对象的疯子解放治疗，藉着帮助他恢复记忆，解开离奇案件之真相。然而，已死的正木教授却又出现，提供了许多扑朔的线索，男子回溯祖先的历史，潜藏在基因中辗转遗传到他身上的祖先记忆一一唤醒。

该片根据日本作家梦野我作的同名侦探小说拍摄，原着《脑髓地狱》被称为“日本第一部魔幻侦探小说”，同时被誉为“日本四大推理奇书”之首。

作为日本“新浪潮”的旗手，更作为纪录片、实验电影先锋的日本导演松本俊夫在1988年拍摄了迥异于其其他作品风格的《脑髓地狱》。

实在很难想像，如此华丽而充满着迷幻、混乱的《脑髓地狱》会出自松本俊夫之手，纵观松本俊夫以往的作品，总是沾染着浓重新浪潮的色彩，并且渗透着纪录片的写实主义风格，他的实验短片，则显现着对于镜头运用等拍摄技巧的实验，显现出先锋色彩。而《脑髓地狱》这样一部色彩绚丽，改编自日本着名推理小说的恐怖剧情片，实在是与松本一贯的风格不相吻合。唯一可以解释松本俊夫拍摄此片的原因，可能是其年轻时候就读东京大学医学院时期对人脑及精神病症着迷研究的经历，使之想要去拍摄充满着同样以大脑、精神病研究为题材的《脑髓地狱》。（金鹰网评）