1950年，唐山交通大学（现西南交通大学）化工系成立。

学术论坛

1952年，全国高校院系调整，化工系主体调整至天津大学，保留部分组建化学教研室，承担全校工科化学基础课教学。

2000年，西南交通大学隶属关係由原铁道部划归教育部直属以后，学校拓宽学科专业面，并以国家西部大开发战略和生物医药产业迅速发展为契机，依託西部生物资源和中药产业优势，在原化学教研室基础上设立了西南交通大学生物工程系。

2002年，学校在峨嵋校区设立了西南交通大学药学院（筹）。

2005年，西南交通大学生物工程系更名为西南交通大学生物工程学院。

2008年7月，根据学校学科最佳化与调整方案，生物工程学院与药学院（筹）合併组建西南交通大学生命科学与工程学院。

据2018年2月学院官网显示，学院开设3个系、开办2个本科专业（包含5个专业方向）。

截至2016年7月，学院拥有3个学术学位一级学科硕士点、3个学术学位二级学科硕士点、2个专业硕士学位领域。

毕业

据2018年2月学院官网显示，学院依託材料科学与工程博士点（创新药物与载体材料方向）招收博士生。

学院生物学科专业教师的研究领域与研究方向覆盖“生物信息学”、“生物化学与分子生物学”、“植物学”、“微生物学”、“遗传学”、“发育生物学”、“细胞生物学”、“生态学”等二级学科，并与医学、农学、工学等大类学科交叉、融合。

学术学位一级学科硕士点：药学、中药学、化学工程与技术

学术学位二级学科硕士点：生物化学与分子生物学、微生物与生化药学、生物化工

专业硕士学位领域：生物工程、製药工程

据2018年2月学院官网显示，学院共有教职工近100人，其中专任教师70余人，其中中国科学院院士（双聘）1名，长江学者、国家杰出青年基金获得者1名，教授13人，副教授36人，60%以上的教师具有博士学位，50%以上的教师具有国外学习或工作的经历。

中国科学院院士（双聘）：隋森芳

长江学者特聘教授：李卫东

国家杰出青年基金获得者：李卫东

据2018年2月学院官网显示，学院拥有1个四川省特色专业，生物工程专业与美国乔治亚州立大学设立（3+1）有本科教育培养项目，与美国乔治亚州立大学设立（1+2）研究生联合培养项目。

四川省特色专业：生物工程

据2018年2月学院官网显示，学院实验室总面积约6000平方米，各种科研仪器设备3500余台套，仪器设备总资产合计约3500万元。

国家交流

截至2016年7月，学院拥有1个国家中医药管理局二级实验室，开设4个研究所、5个研究团队。

国家中医药管理局二级实验室：国家中医药管理局中药化学二级实验室

学院研究所：中药学研究所、套用化学研究所、生物工程研究所、生物化学与分子生物学研究所

学院研究团队：小分子创新药物研究团队、重大疾病新药创製团队、生物信息与功能基因组学研究团队、生物技术製药及载药纳米材料团队、抗感染防治新策略团队

据2018年2月学院官网显示，学院在天然药物研究方面，系统研究了厚朴、蜘蛛香、峨参、荜拨、山胡椒属植物等一批天然药用植物的化学成分、作用机理等，获得了十余项发明专利，并得到了国家科技部“重大新药创製”等项目的资助；在生物製药方面，获得具有强抗癌作用的小分子多肽（自主智慧财产权）研究成果；与企业合作，联合开发具有多种功效的民间中药产品，相关产品已获得地方消字号批文，并进入了实际生产和销售，衍生产品即将获得医院製剂批文；研究了多种微生物及其代谢产物的治疗及保健作用，获得国家自然科学基金的资助；开展了蛋白类药物结肠释放剂型的研究，成功合成了这类剂型所需的包裹材料；主持或承担包括国家自然科学基金、国家863、973、国家科技基础条件平台、四川省科技厅、省中医药管理局等国家和省部级项目以及横向各类项目。

2017年，获国家自然科学基金立项资助8项，其中面上项目3项，青年基金5项，资助经费307.5万元。

院徽由一个实验瓶里长着一颗小树的图案构成，寓意对生命科学的研究。1896是交大的创建时间。

院徽

交大精神：竢实扬华，自强不息

学校传统：严谨治学、严格要求