亚特兰大于1907年由一群富有的瑞士移民建立，初时称为“"亚特兰大" 贝加莫体操及田径运动会社”（Società Bergamasca di Ginnastica e Sports Atletici "Atalanta"），名字取自希腊神话中的女英雄阿塔兰忒，新俱乐部直到1914年才获得义大利足球总会的承认。1924年亚特兰大与同市的“贝加莫体操及箭艺会”（Bergamasca di Ginnastica e Scherma）合併组成“亚特兰大及贝加莫体操及箭艺会”（Atalanta e Bergamasca di Ginnastica e Scherma），于1928年搬迁到现时的会址。

亚特兰大俱乐部成立于1907年，当时奥罗比卡体育俱乐部的五位成员：阿马蒂兄弟（吉诺和费鲁西奥）、吉奥瓦尼·罗伯特、阿里桑德罗·费奥里尼和尤根尼奥·乌里罗决定成立一家足球俱乐部。他们选举维托里奥·阿德拉西奥作为俱乐部的首任主席，并以希腊神话中的美丽女神亚特兰大作为球队的名称。1920年亚特兰大俱乐部同贝尔加马斯卡体操击剑俱乐部合併成立了亚特兰大&贝尔加马斯卡体操击剑俱乐部，并选定黑色和兰色作为球队的标誌色。卢辛格当选为新俱乐部的首位主席。亚特兰大队的首场正式比赛便以4:1酣畅淋漓地击败了对手马斯特里队，而当时的体育场至今仍然充当着俱乐部的主体育场。七十年代初上台的俱乐部主席阿切利·波多洛蒂为球队注入了大笔资金，得到了强大财政支持的亚特兰大队开始了他们的复兴之路。球队于1983～1984赛季冲上了意甲联赛，在此期间亚特兰大队涌现出了很多优秀的球员，其中最为着名的要数随义大利国家队赢得1982年世界盃冠军的加塔诺斯里亚和追随萨基创造米兰王朝神话的中场大将多纳多尼。当时光指向九十年代之后，亚特兰大队却开始了在甲乙级联赛摇摆的“动荡岁月”。但俱乐部仍然在这个期间培养出了多名诸如菲利普·因扎吉和维埃里等叱咤当今意甲足坛的重量级球星。在引进的外援中也不乏大腕，阿根廷着名的“风之子”卡尼吉亚就曾经慕名而来。着名的主教练“银狐”里皮也亲自调教过这支球队。在主教练瓦瓦索里的正确指挥下，亚特兰大队于1999-2000赛季赢得了意甲联赛的入场券，球队的核心是一群非常有潜质的年轻球员，其中包括泽诺尼兄弟、贝里尼、罗西尼、多纳蒂、多尼和扎乌里等多名未来之星，亚特兰大队的再度中兴将指日可待。

亚特兰大于1929年开始参加义大利足球联赛，直至1937年才首次升班到意甲，但随即降级打回原形。亚特兰大于1940年捲土重来再战意甲，并一直保持顶级联赛席位至1958年；仅一季后即赢得意乙冠军重返甲组，更于1963年以3-1击败都灵夺得首次义大利杯冠军。1969年亚特兰大以垫底成绩降级意乙。1970年意乙三队同得47分排于积分榜第二位，亚特兰大在附加赛两战两胜获得升班资格。惟两年后再次降级，开始一段长时期在甲乙组之间浮沉的岁月。亚特兰大在意甲最佳成绩是在1948年所取得的第5位，但于1981年首次降级意丙，幸好仅一季即以冠军身份返回意乙，更于1984年赢得意乙冠军升上意甲。但亚特兰大仍然是升降机，分别于1987年、1994年、1998年、2003年及2005年降级，于2006年以意乙冠军身份升班至今，近三季均处于中游不受降级威胁。

亚特兰大赢得的重要锦标可为绝无仅有，唯一奖盃是1963年夺得的义大利杯。在欧洲赛场更是微不足道，最佳成绩不过是晋级1988年欧洲杯赛冠军杯的四强及1991年欧洲联盟杯的八强。

亚特兰大的青训系统出产无数着名球星，包括多纳多尼（前国家队主教练）、塔奇纳迪（Alessio Tacchinardi）、莫菲奥（Domenico Morfeo）、帕齐尼（Giampaolo Pazzini）、蒙托利沃（Riccardo Montolivo）、佩利佐利（Ivan Pelizzoli）及达拉博纳（Samuele Dalla Bona）等，一一被大俱乐部收归旗下。而曾经效力的着名球员包括卡尼吉亚（Claudio Caniggia）、斯特罗姆博格（Glenn Strömberg）、艾林美奥（Alemão）、蒙特罗（Paolo Montero）、维埃里（Christian Vieri）、因扎吉（Filippo Inzaghi）、伦蒂尼（Gianluigi Lentini）、卢卡雷利（Cristiano Lucarelli）及多尼（Cristiano Doni）等。

亚特兰大是上赛季意甲的大黑马，曾稳居积分榜前3名，但由于后劲不足，最终连联盟杯资格都没有获得。亚特兰大的众多新秀一直是各大球会追逐的对象，经过今年夏天的转会潮，主力阵容变动较大，多纳蒂、C.泽诺尼、佩利佐利、西维利亚投靠豪门，文托拉和莫费奥也回到各自东家。手中有了大笔的现金，亚特兰大也不用像其他中小球会那样小气，泰比、达博、萨拉、奥兰迪尼、里纳尔迪等新人有一定实力。亚特兰大的实力并没有削弱，瓦瓦索里面临的任务是如何儘快捏合队伍，以他的执教水平，亚特兰大在新赛季至少可以稳居中游，但重现上赛季初奇蹟的可能性不大。

2009/10年开季成绩差劣，4战4败敬陪末席，于2009年9月22日辞退主教练安杰洛·格雷古奇（Angelo Gregucci），由前巴里足球俱乐部教头安东尼奥·孔蒂（Antonio Conte）接掌帅印。

2010-2011赛季，亚特兰大还在意乙联赛。该队操纵了部分意乙比赛，使部分预先知道结果的投注者在足球博彩中非法获益。亚特兰大俱乐部只被罚了2.5万欧元。另有6支义大利低级别球队受到处罚，罚分从1分到6分不等；最重的是意乙球队格罗塞托，下赛季被罚掉6分，并被处以4万欧元罚款。

2012/13赛季获得意甲联赛第15名。

2019年5月15日，18/19义大利杯决赛，拉齐奥2比0击败亚特兰大夺得义大利杯冠军。

义大利蓝色竞技球场（Atleti Azzurri d'Italia）是位于义大利贝尔加莫的足球运动场，由亚特兰大与阿尔比诺莱费共同使用，可容24,642名观众，约有8,000坐席，而球场草坪长120米及阔70米。初时名为“Stadio Mario Brumana”，于1928年12月23日揭幕。

这个球场被很多人视为落伍及未达意甲球场的标準，部分看台视野不佳，而大部分看台没有顶盖，虽然有传亚特兰大计画搬迁主场，惟一直只闻楼梯响。

加斯佩里尼（Gian Piero Gasperini，1958年1月26日－），已退役义大利球员。2011-12赛季短暂执教国际米兰足球俱乐部5场比赛之后被解僱，2013-14赛季执教意甲热那亚足球俱乐部。