现设有农学、植物保护和种子科学与工程等3个本科专业；学院拥有植物保护一级学科硕士点1个，植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学等3个目录内二级学科硕士点3个，以及目录外自主设定交叉二级学科“种质资源保护与利用”硕士点1个；拥有植物保护全日制农业推广硕士点1个，植物保护、作物、种业等3个农业推广硕士专业学位培养领域和农业推广植物保护领域校外（南雄）合作办学点1个；目前在校本科生456人，硕士研究生37人。

学院下设植物病理学重点实验室，作物学实验室和植物保护学实验室，植物病理学研究所、外来有害生物预警与控制研究所、作物研究所和种子科学与工程研究所等教学和科研机构。

学院拥有一支高素质、高水平的教师队伍。现有教职工39人，其中教授10人、副教授13人（含副研究员和高级实验师），高级职称教师占教师队伍总数的59%；博士16人、硕士12人，硕士以上学历的教师占教师队伍总数的71 %。拥有农业部油料专家指导组成员1名、广东省农作物品种审定委员会委员2名。

近五年来，学院共承担省部级以上科研项目25项，其中国家自然科学基金项目5项、省部级自然科学基金和科技计画20项，在研总经费2000多万元；共选育出国审、省审农作物新品种8个，荣获国家科技进步奖二等奖1项，省级科学技术奖一等奖2项，省农业技术推广奖和市级科学技术奖7项。拥有省级特色专业1个、校级特色专业1个、校级教学团队1个和校级精品课程2门；校级重点学科（植物病理学、作物遗传育种）2个，校级重点实验室2个。

学院拥有植物病理学重点实验室、作物学实验室和植物保护学实验室，校植物病理学研究所、校外来有害生物预警与控制研究所、校作物研究所、校种子科学与工程研究所等教学和科研机构。

学院已成为仲恺农业工程学院特色明显、优势突出、专业学术水平高、人才培养质量好的创新型和套用複合型人才培养基地，今后将立足广东，辐射华南，面向城乡，服务三农；强化本科教育和研究生教育，为现代化农业发展多做贡献。