2017年2月21日，2017年全国春季游泳锦标赛在陕西省渭南市渭南体育中心游泳馆落幕。男子1500米自由式比赛中，浙江队何峻毅和天津队张博昭分列二、三位。

2017年6月23日，2017年全国夏季游泳锦标赛暨全运会预选赛，男子200米自由式，浙江选手洪金龙和何峻毅分获二、三名，成绩分别是1分50秒44、1分50秒70。

2018年10月20日，2017年全国游泳锦标赛，男子1500自，浙江队选手何峻毅以15分53秒64获得第三，男子100自，以50秒29获得第三。

2018年1月21日晚，2018年全国春季游泳锦标赛。浙江队的何峻毅以49秒90获得男子100自冠军，1分50秒32获得200米自冠军。

2018年4月15日，2018年全国游泳冠军赛男子50米自由式决赛，何峻毅以22秒60获得第三。

2018年8月6日，何峻毅入选第十八届亚运会中国体育代表团名单。

2018年10月16日晚，2018年全国游泳锦标赛，男女4乘100混接力决赛，张雯雯、郑瀚、叶卉妍和何峻毅组成的浙江队以3分54秒54获得第三。13日-17日，2018年全国游泳锦标赛在山东日照举行。何峻毅在接力比赛中连夺两金，分别为男子4×100米自由式接力和男子4×100米混合接力；个人项目上，男子50米自由式决赛中获得第二名；男子100米自由式决赛中获得第二名。

2018年12月，参赛2018年短池游泳世锦赛。

100米自由式何峻毅夺冠

2019年3月28日，青岛2019年全国游泳冠军赛暨世锦赛选拔赛以48秒10的成绩获得冠军，打破他在半决赛创造的48秒29的个人最 好成绩。

2019年7月8日，中国游泳队公布2019年游泳世锦赛参赛名单，何峻毅入选。