科研课题审计是指对有关部、委、办的各种科研专项资金进行审计。

积极开展对科研课题的效益审计。效益审计是中国审计发展的方向,对科研课题的审计更要注重于开展效益分析和评价。科学研究致力于造福人类，其社会效益深远。开展科研课题效益审计，使得审计工作不仅仅着眼于课题预算编报、财务核算等微观个体行为，而是要从经济、政治、社会、历史等多个角度对科研课题进行分析和吸取国际先进做法,结合中国国情,对科研课题效益进行深人细緻和科学地分析。对同类科研课题,审计人员可以建立效益分析模型和指标，不断全面把握科技资金的运行规律,为使有限的科研资金髮挥更大的效益提出建议。同时，开展科研课题审计、有利于提升审计人员素质、综合能力,为效益审计的发展打下基础、积累经验,进一步推动审计工作事业发展。