宝兰客运专线在天水市的线路基本走向为：从牛背梁进入天水境内，桥隧相连，途经麦积区东岔镇、立远乡，在交川沟设东岔站，后经吴砦、元龙、伯阳，跨渭河至社棠，从规划工业园区北缘通过，再跨至渭河南岸，经马跑泉镇，在二十里舖镇花牛村和赵崖村之间设天水南站，出站后桥隧穿越藉河及北山，跨过陇海线南河川车站，经三阳川，跨过渭河，北行出杨家山隧道后溯葫芦河而上，于秦安县城西侧、天巉公路和葫芦河之间设秦安站，后经郭嘉镇，穿大神仙梁，在中川牛谷河进入定西通渭县境内。线路在天水市境内路长约115公里，其中桥隧长105.8公里，桥隧比为92%。

宝鸡至兰州客运专线项目起点位于宝鸡南站，经天水、定西，终点在兰州西站，全长401公里。这条客运专线按国铁Ⅰ级双线电气化设计，项目工程投资预估算总额为564.5亿元，工期4年半。项目建成后，乘火车从兰州到西安的时间将大幅缩短。

宝兰客运专线在天水境内的线路方案已初步确定,线路在天水境内路长约115公里，其中桥隧长105.8公里，设计行车速度为每小时350公里，静态投资约150亿元，设东岔、天水南、秦安3处中间站。

秦安县位于甘肃省东南部，天水市北部，渭河支流葫芦河下游。属陇中黄土高原西部梁峁沟壑区，山多川少，梁峁起伏，沟壑纵横，是全省十八个乾旱县之一，也是全国扶贫开发工作重点县之一。县域东西长约65公里，南北宽约50公里，地势西北高而东南低。最大河流葫芦河由四大支流清水河、南小河、显清河、西小河等河流汇成，自北而南，纵贯秦安中部。县境内海拔1120米—2020米。属陇中南部温带半温润气候，年平均气温10.4℃，正常年景年均降水量507.3毫米。县辖5镇12乡，428个村委会，6个社区，总人口61.6万人，其中农业人口57.4万人。总面积1601平方公里。

宝兰高铁秦安县具体线路：自天水经三阳川杨村西北杨家山隧道至郑川乡邢湾村出口进入秦安县—西川镇 吴川村以东（高架桥）—郑川乡以西（高架桥）—农民村以东（高架桥）—秦安站— 横跨304省道（西大桥西-高架桥）—西川工业园区（高架桥） —张坡村以东（高架桥） —宋场村以西（高架桥）—宋峡村以西（高架桥）—西北方向进入秦安隧道）— 叶堡乡庞宋村出隧道跨越310国道（高架桥顺葫芦河而上）—新阳村跨越207省道—郭嘉镇寺咀村再跨越207省道（高架桥）—郭嘉镇以西—进入郭嘉隧道—王铺乡朱家山大隧道—后向西北进入中川牛谷河通渭县。

中国铁建十七局集团承建的宝兰铁路客专甘肃段第六标段位于天水市麦积区与秦安县境内，线路全长32.6公里。主要工程量有：杨家庄隧道8090.8米/1座、秦安隧道4905米/1座、葫芦河特大桥15104.58米/4座、大桥275.16米/1座、中桥281.3米/4座、小桥69.92米/3座、涵洞114.5延长米/4座，隧道2座总计12.9公里，桥樑13座总计15.8公里，桥隧占管区总长度的88.16%；另外还有路基4.1公里，新建秦安车站1座、秦安梁场和庞家庄梁场2处、预製900吨箱梁450孔，无砟轨道铺设64.729公里等。铁路穿越沿线沟壑纵横，山高谷深，特别是地质複杂，工程存在着：黄土地基沉降、黄土陷穴、古滑坡复活不稳定、土石流及堵沟、大断面软岩隧道开挖和强地震“六大地质风险”。山势险峻，地形複杂，不良地质广为分布，是全线自然环境最艰苦、施工任务最艰巨的标段之一。特别是铁路沿线地表水和地下水丰富，水系发育，环境保护、水土保持要求标準高。

中国铁建十九局承建客专七标段秦安段，正线长度24.268公里，工程内容：桥448.58m/3座；隧道23686.156m/3座（郭嘉镇隧道5131.386m、朱家山隧道14949.77m）,路基133.12m/2段；无砟道床铺设48536 m；全长14949.77m 的朱家山隧道为最长隧道。他们正以”铁军”精神,开拓者坦途。

中铁二十五局集团五公司承建的宝兰客专6标段4工区位于甘肃省内天水市秦安县境内，总长11436.3m，主要工程包括：秦安隧道兰州出口、宋家河中桥、4段区间路基、庞家庄寺咀河特大桥、郭嘉镇中桥、郭嘉镇大桥、郭嘉镇特大桥。秦安隧道兰州出口工程为该工区重难点控制性工程之一，全长2262.3米。

秦安隧道

中国铁建十七局集团承建的宝兰铁路客专甘肃段第六标段位于天水市麦积区与秦安县境内，线路全长32.6公

2009年7月1日，铁道部甘青公司副总经理周军一行来秦安徵求建设宝兰客运专线的意见建议；

2012年3月4日，秦安县召开宝兰客专秦安站站房设计方案徵求意见会；

2012年10月20日，宝兰铁路客运专线甘肃段开工仪式在兰州举行；

2013年2月5日，召开了宝兰客运专线秦安段项目建设工作协调会；

2013年2月25日，由中铁十七局集团第三工程有限公司承建的宝兰客专杨家庄隧道3号斜井率先破土动工；

2013年3月27日，宝兰州铁路客运专线甘肃段六标段（站前工程）第一批物资集中採购招标公告；

2013年6月19日，2013年上半年铁路施工企业信用评价检查组及兰新铁路甘青有限公司安全质量检查组领导一行到中国铁建二十五局集团五公司宝兰客专项目部秦安隧道兰州出口工区施工现场进行检查评比工作；

2013年7月10日，“宝兰铁路客运专线标準化建设现场会”代表参观中国铁建十七局集团工地；

2013年9月21日，秦安县政府领导对宝兰客运专线秦安段拆迁安置工作进行了督查；

2014年3月19日，秦安县委领导深入郭嘉镇、叶堡乡等乡镇协调指导宝兰客运专线秦安段拆迁安置工作；

2014年3月24日，中铁二十一局集团宝兰客专三电迁改工程项目，宝兰客专秦安县郭嘉镇隧道进口至兰州五星坪隧道出口临电线路工程全部完工。