四川亚丁国家级自然保护区位于四川省甘孜藏族自治州稻城县香格里拉镇，甘孜藏族自治州南部，地处青藏高原东部，横断山脉中段，南部与云南省香格里拉毗邻，东南连泸沽湖和丽江。

四川亚丁国家级自然保护区的地理坐标为东经99度58分-100度28分，北纬28度11分-28度34分。

四川亚丁国家级自然保护区主要由“仙乃日、央迈勇、夏诺多吉”三座山和周围的河流、湖泊和高山草甸组成，位于海拔2900米（贡嘎河口）-6032米（仙乃日峰），北峰仙乃日峰海拔6032米，南峰央迈勇峰海拔5958米，东峰夏诺多吉峰5958米。截至2019年10月是中国保存最完整、最原始的高山自然生态系统之一。

四川亚丁自然保护区属大陆性季风高原型湿润气候，由于区内海拔相对高差达3000米，因此气候的垂直分异明显：海拔3200米以下为山地暖湿带，3200-3600米为山地中温带，3600-4300米为山地寒温带，4300-4600米为高山亚寒带，而海拔4600米以上为高山寒流冰雪带。

四川亚丁国家级自然保护区总面积1457.5平方千米，截至2016年10月已开发面积为32.44平方千米，森林面积达560平方千米。东南与凉山州木里县接壤，西部与乡城县、云南省中甸县毗邻、北面与理塘连线。

四川亚丁国家级自然保护区的目的主要是保护其丰富的动植物资源，複杂多样的生物基因，罕见的自然景观及其赖以存在的极高山自然生态系统，自然资源保护是保护区的主要功能。

四川亚丁国家级自然保护区野生动物约200余种，主要以高山动物，森林动物为主，由于该地区为典型的横断山脉地带，区内属南方动物区系的有小熊猫、林麝、白臀鹿、牛羚等：属北方动物系的种类有狼、猞猁、岩羊、藏鼠兔等。区内动物属国家一、二级保护动物的有牛羚、小熊猫、水鹿、白臀鹿、林麝、豹金猫、羚、斑羚、黑熊、短尾猴等。此处黄鼬、松鼠、灰尾兔、猪獾等分布数量较大。

四川亚丁国家级自然保护区地形複杂，气候多样，是一个特殊的生态地理区域，植物资源十分丰富，构成了複杂多样的植被类型，具有高等植物1115种，有维管束植物12l科，430属，其中蕨类植物20科，34属，103种，种子植物101科，396属，1012种，区内属国家二、三级保护植物有玉龙蕨、扇蕨、扇核木、长苞冰杉、丽江铁杉、桃儿七、八角莲、四川牡丹、金铁锁等。区中属国家保护鸟类有：藏马鸡、金鸡、藏雪鸡、雉鸡、雪雉等。属中国特产种有：花背噪鹛、橙枝噪鹛、褐背松地雉等；鱼类种类较丰富，主要种类有四川裂腹鱼、短须裂腹鱼、厚唇裸重唇鱼、松潘裸鱼鳅、梭形高原鳅、斯氏高原鳅、黄石爬等。

仙乃日（藏语：观世音菩萨）、降边央（藏语文殊菩萨）、夏纳多吉（藏语金刚手）三座雪山相距不远，各自拔地而起，呈三角鼎立，藏传佛教称为“日松贡布”，意为三怙主神山。北峰仙乃日海拔6032米，南峰降边央海拔5958米，东峰夏纳多吉海拔5958米，三座雪山峰峰形各异，但都洁白无瑕，一尘不染。山腰茫茫林海，飞泉瀑布于其间，山脚宽谷曲流，镶嵌着湖泊。

三怙主神山

珍珠海，藏语名叫“卓玛拉措”（意为“度母神湖”），是仙乃日融雪形成的海子，面积约0.1平方千米。

五色海，藏语名叫“丹增措”，由于光的折射下，湖面呈现出五种不同颜色而得名，位于仙乃日与央迈勇之间，海拔4600米，湖面呈圆形，面积0.58平方公里。

牛奶海，藏语名叫“俄绒措”，牛奶海在央迈勇雪山的山坳里，呈扇贝形，因中间是碧蓝的雪水，周边一圈乳白色的水环绕而得名，它是古冰川湖，状如水滴，四周雪山环绕。

1982年11月，中国第一届自然保护区学术讨论会召开，印开蒲提议建立稻城亚丁自然保护区。

1987年，四川省人民政府成立了“川西北地区国土综合开发规划领导小组”，正式将四川亚丁自然保护区列入了“川西北地区生态建设和环境保护重点项目”之中。

1996年3月20日，以亚丁村命名并建立四川亚丁县级自然保护区。

1997年5月，四川亚丁县级自然保护区升级为四川亚丁州级自然保护区，并成立四川亚丁自然保护区管理局。

2017年12月，四川亚丁州级自然保护区升级为四川亚丁省级自然保护区。

2001年6月，四川亚丁省级自然保护区升级为四川亚丁国家级自然保护区。

2003年7月10日，四川亚丁国家级自然保护区被列入教科文组织“人与生物圈计画（MAB）”，正式加入世界人与生物圈保护区网路。

2016年10月7日，四川亚丁国家级自然保护区管理局正式发布公告，禁止一切单位或个人进入四川亚丁国家级自然保护区开展非法穿越活动，违者将根据法律法规被移送公安机关处理，直至追究刑事责任。

地质年代第四纪（250万年）以来，由于受新构造运动的影响，四川亚丁国家级自然保护区所在地区发生了强烈的抬升和断裂，形成了特有的高原峡谷地貌。保存了以冰峰雪岭、冰川宽谷、原始森林和高原草甸为主的极高山自然生态系统。从保护区北部海拔2909米的康古，至仙乃日主峰直线距离仅18千米，相对高差达3123米。巨大的垂直高差形成幽谷深邃、千刃壁立的高山峡谷景观。独特的地质、地貌与气候条件使四川亚丁国家级自然保护区至今还保存着原始状态的自然生态系统，保存了大量第四纪以来（距今250万年）多数地区已绝迹的珍稀动物、植物、昆虫等活化石，成为重要的地质历史博物馆和物种基因库。同时也是全球生物地理区域中的最具代表性的地区之一，具有极为重要的保护价值和科学研究价值。由于该区域独特的地理位置，其环境基本未受人类活动的干扰和破坏，原始风貌保存较完整，加之独特的自然景观，被誉为“最后的香格里拉”在中国国内外亨有较高的知名度。

2017年5月2日，由稻城亚丁景区管理局主办的龙腾亚丁Skyrun天空跑46KM“超级转山”和29KM“天空跑”国际越野积分赛在四川亚丁国家级自然保护区举行。

2018年4月28日，2018飙山越野·龙腾亚丁越野嘉年华将作为2018年Skyrunner全球系列积分赛的揭幕赛在四川亚丁国家级自然保护区举办。

从亚丁管理站至沖古寺及洛绒牛场有交通车乘坐，到达洛绒牛场后是徒步道路，前往牛奶海和五色海只能徒步或者骑马。