1989年7月进入中国对外贸易运输总公司工作，历任汽车管理部科长、中国外运贵州公司总经理，中外运汽车运输有限公司副总经理，中国对外贸易运输（集团）总公司企业管理部总经理。2002年8月至2008年12月，任中国对外贸易运输（集团）总公司总裁助理。2008年12月起，任中国外运长航集团有限公司总裁助理。

2015年11月4日，国资委发布了一批央企领导人员任免讯息，经研究，提名秦伟为中国外运长航集团有限公司副总经理人选。

2016年2月，秦伟任中国外运长航集团有限公司副总经理。