“中国期刊方阵”的基本框架分为4个层面，形成宝塔形结构。

以全国现有8135种期刊为基数，按10%—15%的比例选取社会效益、经济效益好的1000余种期刊，作为“中国期刊方阵”的基础。通过各省（区、市）和中央部委评比推荐产生。

即通过每两年一届评比产生的百种重点社科期刊、百种重点科技期刊。每届进入全国“双百”重点期刊数量控制在200种左右。

是全国“双百”重点期刊基础上评选出的国家期刊奖、国家期刊奖提名奖的期刊。此类期刊约100种左右。

即高知名度、高学术水平的期刊。此类期刊约50种左右。

为展示中国期刊方阵的力量加强对建设“中国期刊方阵”的宣传，已定于2006年11月举办中国期刊展，并召开建设“中国期刊方阵”的研讨会。为抓好期刊集团试点，目前已重点支持10多个期发量在百万份以上、年利润在3000万元以上有相当实力的期刊，这些期刊都有扩展的愿望和条件，以此为基础，2001年内将组建3至5个期刊出版集团。与此同时，还积极探索让有实力的期刊到国外去办刊，第一批计画选择3—5个国内名牌期刊，採取独资办刊、合资办刊、着作权合作办刊等多种形式到国外开发市场。政府有关部门将给予必要的支持和帮助。

建设“中国期刊方阵”的运作步骤採取分级负责的形式，各省的“双效”期刊由省级新闻出版管理部门按照规定比例推荐，入选期刊必须是省、部级以上优秀期刊，或有希望成为优秀期刊者。“双奖”和“双百”期刊通过评选产生。“双高”期刊由新闻出版总署、科技部确定，入选期刊均为国内知名品牌期刊。