德州高新技术产业开发区前身为禹城高新技术产业开发区，位于禹城市区东部，1999年3月启动建设，2002年9月被省政府批准为省级高新区，2003年2月科技部批准建立国家火炬计画生物技术产业基地，2004年12月正式挂牌，2014年7月更名为德州高新技术产业开发区，是山东省首家设在县市的省级高新技术产业开发区。总规划面积68.15平方公里，功能分区科学，基础设施完善，实现了“九通一平”。区内上市企业3家、场外挂牌交易3家、新三板上市1家。先后荣获国家高技术（生物）产业基地核心区、全国百佳科学发展示範园区、山东省最佳投资园区、山东省首批科技兴贸出口创新基地、山东省生态经济十佳开发区、山东省县域经济十大规模企业聚集园区等荣誉称号。

国务院下发档案(国函【2015】171号)，国务院正式批准德州高新区升级为国家高新技术产业开发区，定名为德州高新技术产业开发区，标誌着德州高新区成功跻身“国家队”，这也是全省首家设在县级的国家高新技术产业开发区。