1959年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》创刊，初期为不定期刊物。

期刊封面

1966年，因“文革”被迫停刊。

1973年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》与《内蒙古大学学报（社会科学版）》合併为《内蒙古大学》出版。

1977年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》正式复刊，时为半年刊。

1980年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》改为季刊出版。

1983年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》正式在中国国内外公开发行。

1993年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》改为双月刊。

2014年11月，学报入选原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

《内蒙古大学学报（自然科学版）》主要刊登数学、物理学、化学、生物学和技术科学、交叉科学等基础研究和套用研究方面的学术论文。

学报设有数学、物理学、化学化工、电子信息、计算机科学、生物学、生物工程、研究简报等栏目。

截至2014年9月，《内蒙古大学学报（自然科学版）》有专职编辑人员3人，其中编审1名、副编审1名、编辑1名，具有博士学位1人、硕士学位1人、本科1人。

截至2007年7月，《内蒙古大学学报（自然科学版）》编委会有委员19人。

据2018年10月24日中国知网显示，《内蒙古大学学报（自然科学版）》出版文献4554篇。

据2018年10月24日万方数据知识服务平台显示，《内蒙古大学学报（自然科学版）》共载文1833篇。

截至2014年9月，《内蒙古大学学报（自然科学版）》共出版了45卷197期。

据2018年10月24日中国知网显示，《内蒙古大学学报（自然科学版）》总被下载445404次、总被引20690次、（2018版）複合影响因子为0.345、（2018版）综合影响因子为0.203。

据2018年10月24日万方数据知识服务平台显示，《内蒙古大学学报（自然科学版）》被引量为9623、下载量为53061；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）来源数据显示，《内蒙古大学学报（自然科学版）》影响因子为0.346，在全部统计源期刊（6735种）中排第3928名，在大学学报（自然科学）（269种）中排第160名。

《内蒙古大学学报（自然科学版）》美国《化学文摘》（CA）、俄罗斯《文摘杂誌》、日本科学技术文献速递（JICST）、《中国科学引文索引》、《中国学术期刊文摘》、《中国数学文摘》、《中国物理文摘》，《中国生物学文摘》及中国科学引文资料库、中国学术期刊（光碟版，全文）、万方网路全文资料库、中国期刊网全文资料库、中文科技期刊资料库（重庆维普）等收录；是北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊（2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版）。

1993年，在全区首届科技期刊评比中，《内蒙古大学学报（自然科学版）》被评为内蒙古自治区优秀科技期刊。

1994年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》被“国家核心期刊研究会中国自然科学核心期刊课题组”确定为中国核心期刊，同年被评为华北地区优秀期刊。

期刊封面

1995年，在国家教委主办的优秀学报评比中，《内蒙古大学学报（自然科学版）》被评为A类学报（重点大学学报）第25名，同年获内蒙古高校优秀学报称号。

1996年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》获国家优秀期刊三等奖。

1997年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》获第二届内蒙古科技期刊一等奖及第二届全国优秀科技期刊三等奖。

2000年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》被《中国中文核心期刊要目总览》确定为“综合性科学技术类”核心期刊，同年获《CAJ-CD规範》执行优秀奖。

2001年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》获首届内蒙古期刊编校质量优胜奖。

2002年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》获第二届内蒙古期刊奖及第六届“华北十佳优秀期刊奖”。

2004年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》被确定为“综合性科学技术类”核心期刊。

2006年、2008年、2010年、2012年、2014年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》连续五届获“中国高校优秀期刊奖”。

2007年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》被评为全国民族地区自然科学版“十佳”学报。

2008年，《内蒙古大学学报（自然科学版）》获得首届内蒙古高校精品学报奖、第二届中国高校优秀科技期刊奖。

《内蒙古大学学报（自然科学版）》旨在反映内蒙古大学师生员工或学校师生员工与校外其他同志合作，在自然科学领域做出的创造性科研成果。

学报以其蒙古学、北方民族学和地区动植物学、生态学为自己的重点和特色，明确地服务于内蒙古大学的教学科研，服务于内蒙古自治区经济文化建设和社会发展，服务于为自治区和祖国社会主义建设需要的各民族人才的培养。

内大学报承担了两个任务。第一，科学需要青年，现行的研究生制度把导师和学生结合起来，既培养了人，又出了研究成果，是一个好体制。科学研究成果必须有适当的发表园地，内大学报是内大教师和研究生承担科研任务发表研究成果的园地。正因为如此，随着内蒙古大学研究生数量的增加，学报的版面也在不断扩增。通过这个视窗，可以看到学校科研任务完成的情况，看到很多优秀的学生导师合作的论文，也可看到一批又一批硕士生和博士生的成长曆程。第二，内大学报是国际和国家学术刊物的重要补充。很多研究工作特别是基础研究的评价，是论文发表后若干年后的事。而一个不断产生高水平科学成果的社会一定能向它的成员提供及时发表研究论文的园地，并在此基础上有科学家圈子内的自由而严格的批评，然后产生高质量的成果。没有发表，就没有公正的批评，也不会有质量。现在，由于参加科学研究人员队伍的扩大，论文产出数量远大于刊物容纳量，很多论文都扼杀在投稿过程中。如果说，一个刊物的拒稿率50%，尚能说明这个刊物的严谨性；那幺，当它的拒稿率达到90%以上，就很难保证没有扼杀富有创见的论文了。解决这个问题的办法之一就是用高等学校学报来补充科学刊物之不足。在这方面，内大学报也做出了应有的贡献。（内蒙古大学教授、博士生导师罗辽复）

搭建学术交流大平台，服务教学科研新发展。（中华人民共和国新闻出版总署）