安徽中医药大学创建于1959年，其前身为1952年创立的安徽省中医进修班（学校）。

安徽中医药大学 校门

1959年，安徽省政府正式批准成立安徽中医学院，郭沫若先生题写校名。

1970年，安徽中医学院併入安徽医学院。

1975年，国家教育部批准恢复安徽中医学院。

2000年，安徽省医药学校併入安徽中医学院。

2005年以良好成绩顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估。

2009年学校以优异成绩全国第三家通过国家教育部中医学专业试点认证。

2011年，安徽省政府批准在安徽中医学院的基础上组建成立安徽省中医药科学院。

2013年，经中国教育部批准，安徽中医学院升格更名为安徽中医药大学 。

2014年，学校成为安徽省高等教育振兴计画第二批“地方特色高水平大学建设”项目立项建设高校。

截至2014年12月，学校有教职工2500多人（含两所附院），其中副高以上职称人员500余人。国医大师1人，皖江学者·讲席教授2人，博士生导师22人，硕士生导师333人；享受国务院特殊津贴35人、省政府特殊津贴5人；安徽省学术与技术带头人、后备人才18人；国家名老中医学术经验项目指导老师26人；国家级教学团队2个、省级教学团队2个。有来自中国国内外的56名知名专家学者担任该校客座教授。

国医大师：徐经世

截至2018年5月，学校有16个二级学院（部）（含3所直属附属医院）、5所非直属附属医院，开办24个本科专业。

学校1978年开始招收硕士研究生，1981年首批获硕士学位授权，1999年开始联合培养博士研究生，2008年获得开展硕士研究生推荐免试资格，2013年被教育部批准为博士学位授予单位。

截至2014年12月，学校有2个一级学科博士学位授予点，4个一级学科硕士学位授予点、25个二级学科硕士学位授予点、4个硕士专业学位授权点，5个博士生联合培养基地。有17个国家中医药管理局重点建设学科、1个省级重中之重学科，12个省级重点建设学科，7个卫生部国家临床重点专科，21个国家中医药管理局重点建设专科、23个安徽省中医药重点专科。

一级学科博士学位授予点：中医学、中药学

一级学科硕士学位授予点：中医学、中药学、中西医结合、药学

硕士专业学位授权点：临床医学、中药学、药学、工程（製药工程）

安徽中医药大学是国家中医临床研究基地、国家中药现代化科技产业（安徽）基地、国家中医药国际合作基地、国家药品临床研究基地、硕士研究生推荐免试单位。2005年以良好成绩通过国家教育部本科教学工作水平评估，2009年学校以优异成绩通过国家教育部中医学专业试点认证。

截至2014年12月，学校有国家教育部高等学校特色专业5个、省级特色专业3个、安徽省教学改革示範专业4个，1门国家级精品课程、16门省级精品课程。有2个国家级精品资源共享课程，1个国家级实验实训示範中心，3个省级实验实训示範中心，1个省级人才培养创新试验区。

2009——2014年，学校先后获国家级、省级质量工程项目100余项，国家级教学成果奖2项、省级教学成果特等奖2项、一等奖7项。学校还举办了新安医学教改实验班，在临床专业建立客观化结构考试中心。

国家教育部高等学校特色专业：中医学、针灸推拿学、中西医临床医学、中药学、药学

省级特色专业：套用心理学、中西医临床医学、药学

安徽省教学改革示範专业：中药学、中医学、康复治疗学、国际经济与贸易（医药贸易）

省级人才培养创新试验区：校-师承教育与区域特色相结合的中医学人才培养模式创新实验区

国家级实验实训示範中心：中药类实验教学中心

省级实验实训示範中心：药学类专业综合技能示範实习实训中心、临床技能综合实训及OSCE中心、针灸康复实验实训中心

国家级精品资源共享课程：中医基础理论、方剂学

2010年开始与长春、福建2所中医药大学开展相互交流培养学生；设立大学生课外科技创新与创业基金；开展“百人获奖、千人参与、万人受益”的大学生知识技能竞赛和“挑战杯”等各级各类竞赛活动；广泛开展各类社会实践活动。2008—2013年学校共有学生200余人次在学术科技与创新创业领域获省部级以上表彰和奖励70余项（其中获全国大学生管理决策模拟大赛特等奖1次、全国“挑战杯”大学生创业计画竞赛三等奖1次、全国“挑战杯”大学生课外学术科技作品竞赛三等奖2次）。2008年——2014年，学校毕业生平均就业率在94%以上，连续获得安徽省普通高校就业工作“先进集体”或“标兵单位”称号。

截至2014年12月，学校有3所直属附属医院（第一附属医院、第二附属医院、第三附属医院）、4所非直属附属医院。

其中第一附属医院是全省最大的三级甲等综合性中医医院；第二附属医院是全国首家三级甲等针灸专科医院；第三附属医院是国家第三批重点建设的中西医结合医院，神经病学研究所附属医院是一所以“肝豆状核变性诊治”为优势的专科医院，国医堂是一所为广大患者以纯中医方式为主要医疗手段的医疗单位。

截至2014年12月，学校与美国、澳大利亚等26个国家和地区的41个医疗和教育机构建立了友好合作关係。1994年获準招收国外留学生，先后有20多个国家和地区的学员来校攻读硕士、学士学位以及临床研修。与美国、瑞典、新加坡、日本、韩国及港澳台地区的院校开展学者互访和学生交流活动。

此外，学校与黄山、亳州、绩溪、舒城等市县人民政府签订全面合作协定，与河南宛西、江苏康缘、深圳三九等中国国内知名中医药企业签订战略合作协定，建有亳州济人药业等25个产学研合作基地，开展50多项技术服务。

截至2014年12月，学校有4个省级科技创新团队，24个省级以上重点实验室及工程（技术）研究中心，建立了安徽省计算机中医套用研究所、临床医学研究所、现代中药研究中心、科研实验中心、药物研究所、中西医结合研究所、新安医学研究中心、中医药研究所、神经病学研究所等研究机构，此外该校还建立了安徽省中药材科技产业战略联盟。

教育部重点实验室：新安医学教育部重点实验室

安徽省重点实验室：针灸基础与技术安徽省重点实验室、现代中药安徽省重点实验室、安徽省中药研究与开发重点实验室

安徽省工程技术研究中心：现代中药安徽省工程技术研究中心

安徽省2011协同创新中心：安徽道地中药品质提升协同创新中心

国家中医药管理局中医药科研实验室（基地）：现代中医内科套用基础与开发研究实验室、数位化影像技术实验室、中药药剂实验室、神经生物学（针灸）实验室、免疫实验室、细胞分子生物学（脑病）实验室、慢性阻塞性肺疾病肺气虚证重点研究室、国家中医临床研究基地

2009-2014年，学校共承担各级各类项目1500余项，其中承担国家“973”计画、国家“863”计画、国家科技支撑计画、星火计画重点项目、重大新药创製专项、国家自然科学基金和社会科学基金等国家级项目136项，科研经费2亿余元；取得研究成果300余项，获得省部级以上科技奖励27项（其中国家科技进步奖2项）。

在2015年度国家自然科学基金申请项目评审结果中，该校2015年度获得立项资助项目23项，共批准直接经费947.9万元（经费总额约1185万元），超过了历年的资助额度。

2010年6月，该校图书馆被国务院批准为“全国古籍重点保护单位”。

据2015年9月学校图书馆官网显示，该校图书馆有中医药书库、线装书库、样本书库、外文书库、中文二线书库等各类书库和专业期刊阅览室、过期报纸阅览室等各类阅览室、电子阅览室、自修室等总计26个，此外，还建有安徽首家古籍修复室；馆藏各类纸质文献89.9万册（含教学院部5万册），订阅中外文纸质期刊1521种，拥有《中国学术期刊全文资料库》、中国优秀硕士、博士论文全文资料库、万方《数位化期刊资料库》、万方《中国学位论文资料库》（博硕士论文），《中国生物医学文献资料库》、《中国药学文摘资料库》、《中国中医药资料库》、《银符线上考试题库》、《读秀学术搜寻》、《人大複印资料库》、《万方医学视频资料库》、《ScienceDirect》、《Springer外文期刊全文资料库》、《泉方外文期刊资料库》等中外文资料库27个，超星与中国数字图书馆、北大方正、书生之家、EBM等电子图书共80.2万余册，并有部分网上免费资源，电子资源容量已达65.6T。已建立起系列伺服器群，拥有了较完善的内部网路信息服务平台。

《安徽中医药大学学报》（原名《安徽中医学院学报》）是由安徽省教育厅主管、安徽中医药大学主办的综合性中医药学术期刊，创刊于1981年12月。
该刊得到上级主管部门多次表彰和奖励：1989年获全省高校自然科学学报三等奖；1990年获全国高等医药院校学报二等奖；1995年获全国高校优秀自然科学学报三等奖，全省高校优秀自然科学学报二等奖，全省优秀科技期刊三等奖；1998年获全省优秀科技期刊二等奖；1999年获全国优秀高校自然科学学报三等奖，全省高校优秀学报一等奖；2002年获安徽省优秀科技期刊三等奖；2004年获中国高等学校自然科学学报二等奖和安徽省高等学校自然科学学报二等奖；2005年获安徽省优秀科技期刊二等奖；2008年获第二届中国高校优秀科技期刊奖；2009年获全国高校科技期刊优秀编辑质量奖和安徽省高校优秀学报二等奖；2011年该刊编辑部获“中国高校科技期刊优秀团队”称号；2012年获第四届中国高校优秀科技期刊奖；2013年获第二届中国高校优秀科技期刊网站奖及安徽省优秀科技期刊奖。另外，该刊编辑人员曾多次受到国家教育部、卫生部、新闻出版总署，省科技厅、教育厅的表彰和奖励。
并连续被中国科学技术信息研究所列为《中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊）》，并被《中国学术期刊综合评价资料库（CAJCED）》《中国期刊全文资料库（CJFD）》《中国核心期刊（遴选）资料库》《中国生物医学文献服务系统（SinoMed）》及美国《化学文摘》等资料库收录。

安徽中医药大学学报

1961年，时任全国人大常委会副委员长的郭沫若先生，应该校邀请，亲自为该校前身“安徽中医学院”题写过校名。 “药”“大”二字均选自郭沫若的其他书法手迹。标準字型为郭沫若体。

校徽以“悬壶济世”典故为切入点，以安徽地域特色的徽派建筑（马头墙）为形，辅以太极、蛇杖、中草药构筑成一个完整的“中”字，表达中医治病救人的仁德。药葫芦代表以中医济世着称的“北华佗”医学流派，徽派建筑则代表“南新安”的新安医学，两个医学文化在安徽中医药大学交融，得到传承。标誌中间部分似手掌形，代表中医的把脉。在徽派建筑（马头墙）框架里，药葫芦内含乾坤太极，又融合了世界常用的蛇杖医学标誌，杖也可以理解为针灸之银针，表明在继承和发扬中医传统精华的同时，更有积极开放的胸襟和创新的精神。

校徽

至精至诚：学校的育人理念。取意“大医精诚”，培养医术精湛和品德高尚的学生。

校训

惟是惟新：学校的发展理念。以改革、创新的精神，思考中医发展规律，谋划学校发展大事。校训标準字型採用中国北宋书法家、画家、书画理论家米芾手体。

2018年1月18日，新华社新媒体专线播发《(中国网事)住院拿药像点菜，社保卡医院随意刷——安徽一医院骗保黑幕触目惊心》，独家报导了安徽中医药大学第三附属医院骗保问题，引起社会广泛关注。

2018年1月19日，在事件曝光的第二天，由安徽省人社厅、安徽省卫生计生委、安徽省中医药管理局、安徽省中医药大学等部门组成的联合调查组即进驻该医院展开调查。人社部和国家中医药管理局也专门派员赴安徽督促调查。

2018年2月3日，记者从安徽中医药大学第三附属医院骗保事件的联合调查组获悉，经调查，安徽中医药大学第三附属医院骗保问题基本查实，目前调查报告已上报安徽省政府，接下来将会依法依纪对相关责任人员进行问责处理。